(遼寧)八旗水師。在清軍入關之前，出於戰爭需要，最先創設吉林八旗水師。當時並沒有固定的組織編制，直到順治十八年清廷才正式在吉林城組建八旗水師營。
現在的吉林八旗水師設有正三品總管一人，四品軍官二人，其他各級武官二十人，水兵匠役有三千人。擁有戰船三十艘，運糧船八十艘，在今年又增添了槳船和划子船各二十艘。此外，原先在吉林城東北的松花江畔築有烏拉城，這裏是沿江的民船集中地，有捕珠大船七艘、威呼船四百艘（采珍珠用的單人或雙人小船），統由吉林水師營兼管，現在處於戰時也被徵用。
奉天水師籌建的稍微晚一些，但也是在順治初年，清廷在旅順口組建了八百人的金州水師營，船是從山東綠營水師調來的，也就十艘趕繒船，還有其他一些小船。至於兩年前康熙於黑龍江的黑龍江城(愛輝)、齊齊哈爾、墨爾根(嫩江)、呼蘭四個地方在原黑龍江水師的基礎上擴建設立的四個水師營，水師總數稍稍多些，有兩千八百人。
而此刻的三個八旗水師營早已經被調到天津，組建出了天津八旗水師，拱衛京師的安全。但是吉林八旗水師和黑龍江八旗水師很多都是人到了天津可是船卻無法過來，只有奉天水師全部開了過來，其他的只能是從天津這邊籌集。不過一直一來清廷都有命令各省打造船隻，因此這船隻的問題倒是不大，除此之外，沿江上下很多的民用船隻也都被徵用。清廷雖然名義上發文說給了銀子，只是到了下面，具體辦事的官吏卻是上下其手貪墨了許多。
除了這些八旗水師，重點就是長江山的那些綠營水師了。這些綠營水師完全就是繼承於前明的水師。淡然這些年還是有不少的發展的。這明末水軍與清初水師都有一個共同點就是都比較注重對海上戰船的建造與檢查，清朝建立後，清廷為防鄭成功水軍，在江南與福建造了不少戰船，同時實行海禁。進行嚴格的船隻管理。只不過在福建的那上百艘大小船隻都被馬尾軍合併了，這一點倒是讓康熙恨得牙根痒痒。
明末，崇禎皇帝既要對抗北部清軍和李自成起義軍的進攻，又要抵禦南部鄭氏武裝船隊的進攻，疲於奔命，於是準備大造海船。先是兵部大臣向皇帝要三千艘戰船，然後工部回覆：按照客觀規律和「會典舊例」，包括材料「油釘板木」的供給，船隻質量的保障等問題，只能造一千五百艘戰船。沒想到崇禎帝聽取了工部的回覆。還真就命工部造船主事朱正色正式前往淮安的清江船廠督造海船。
明末淮安的清江船廠主要生產內河漕運船和「直隸、南京、中都、江北、山東、北直隸等總淺船」，總淺船屬近海漕運船，與遠海作戰海船差距較大。朱正色先是監造一小批海戰船作試驗，看是否符合南北方遠洋作戰要求。建造過程中朱正色還對這一小批海戰船進行突擊性監督質量檢驗，確保可以出海航行。
可是在這一小批海戰船造出後，朱正色查驗船質情況，發現「板木不同，釘鐵不同，式樣不同，航艉不同。索攬器用不同」，認為造出的船型還是內河船，不符合遠海作戰與航行要求，如果大批量生產一千五百艘這樣的「海戰船」。將嚴重危及明朝命運。於是朱正色向崇禎皇帝建議，不在淮安船廠造海戰船。
朱正色吸取經驗然後請求在造船技術條件更成熟的廣東與福建船廠建造一千五百艘海戰船。崇禎再次接受了他的建議。這一點耿精忠一直倒是相當佩服崇禎皇帝的，由漢人統治幾百年的明朝，他從未其他國家妥協。明廷寧可亡國，也不與清軍或李自成的起義軍談判，或簽訂某某條約。於是。後來李自成率農民軍攻入北京，崇禎在景山自縊，明朝滅亡。同年十月，清朝趕跑李自成，定都北京。
明朝滅亡之後，水師就全被清廷接收，長江山的很多戰船還是當年的老式船隻，海船並不多。可是不能忽略的是，順治初年順治帝便下旨以京口、杭州水師分防海口，這當然是綠營水師。到了順治八年的時候，開始在沿江、沿海各省，循明代舊制，設提督、總兵、副將、游擊以下各武員，遵循陸營之制。各省設造船廠，定師船修造年限，三年小修，五年大修，十年拆造。除設立水師建制外，順治六年的時候清廷開始在各省設修造船廠。
清初船廠的戰船造好後，按照質量檢查條例，先由各省的造船承修官與各道的造船督修官，檢查船質；
