所軍。反倒是等這個地方都督府成立之後，督撫對於地方軍隊的控制權力就化為了烏有。
因此，只要不是面臨戰爭危機和衛所財政問題，誰也不願意讓朝廷派員削減自己手裏的權力。不過，不管是衛所將領、兵備道、兵馬副使，還是地方督撫，也不敢公然反對內閣通過的改革方案。
他們不過是採取了消極抵抗，和不停的向朝廷發出題本，聲稱擅自更改祖制恐怕會影響各地衛所軍隊對朝廷的忠誠心，從而引發地方變亂。要求朝廷建立地方都督府的舉措不要過於激進，而是以3-5年，或是以8-9年為期，妥當而慎重的逐步成立地方都督府這個機構。
總參謀部起初是以孫承宗的門生故吏為核心建立起來的新機構，它剛剛開始出現的時候，是為了整合五軍都督府對各地衛所軍隊的統一管理權力，並架空了京城勛貴和將門充斥的五軍都督府。
由於受到損失的是勛貴和武官集團的權益，因此剛開始的時候大家還是非常支持總參謀部的工作的。在不少官員眼中，孫承宗起碼是文官集團的一份子，總參謀部的成立等於在朝中驅逐了勛貴武將集團最後的存在，讓文官們完全掌控了朝廷大政，這是一件好事。
就在他們還在積極的支持總參謀部對於五軍都督府的奪權行動時，因為兵部發生的幾件貪污案，總參謀部立刻轉身對付起了兵部，從兵部手中奪取了不少權力，並以軍令和軍政分離的藉口，把邊軍的後勤供應先搶到了手裏。
邊軍的後勤供應，一向掌握在兵部派出的兵備道手裏。兵備道出現於洪熙年間，在正德、嘉靖年間開始在地方大肆設置，並以為常設機構。各地兵備道根據職責不同，也有兵備、兵巡、巡海三種稱呼，以各省按察司官員出任這一職務，不過兵備道的設置和裁革皆由兵部負責，因此兵備道算是兵部在地方的分支機構。
兵備道的權力很是繁雜，監察權、司法權、軍事職權之外，就算是地方民務有時也可過問。當然，兵備道最為主要的職責還是:分理軍務，操練衛所軍隊和地方民快，緝捕盜賊鎮壓民亂，管理衛所兵馬、錢糧和屯田，巡視江湖防禦等。
總的來說，一個兵備道就等於一個小小的都督府。總參謀部在各地建立都督府，首先剝奪的，便是這些兵備道的權力。一旦失去了兵備道的職官，這些按察司官員也就失去了自己手中最大的一塊權力。
因此對抗總參謀部最為積極的，便是這些地方上的兵備道。總參謀部制定出來的衛所改制、編練新軍和建立地方軍隊後勤系統的計劃，往往剛到地方就被這些兵備道使出了渾身解數抵擋了下來，無法落實下去。
去年豐鎮一役，憑藉着大明軍隊少有的勝利，總參謀部一舉拔掉了大同、宣府等地的兵備道，建立了自己的後勤管理體系。但是大明其他地方的衛所將領和兵備道官員，也就是老實了一些，但卻依然在暗中抵制總參謀部下達的命令。
在這樣的時刻，如果能夠擊敗大明最為險惡的敵人，也是被各地明軍看做野戰無敵的女真大軍，那麼總參謀部頒發的命令才能讓這些衛所將領們感到敬畏。
不管大明的軍隊再怎麼腐化，軍隊的本質決定了，誰的武力強橫，誰在軍中就有最大的話語權。那些兵備道不過是依仗着朝廷體制，才能對各地衛軍呼來喝去，他們依然還是游離在軍隊體系之外的官員。
一旦這些兵備道的身後失去了朝廷的威嚴，衛所軍完全可以不必理會，這些沒有實力的文官們。當這些兵備道試圖利用衛所軍來對抗總參謀部的命令時，他們便已經失去了自己身上最強有力的權力象徵。
這也是為什麼，當崇禎殉國，北京淪陷之後，幾乎一夜之間，大明各地的衛所將領就成為了大大小小的軍閥頭子，再也不願意聽從文官們的指令了。因為從這一天開始，這些文官身上就失去了朝廷法理和這些衛所軍聽命效忠的理由。
比如現在對於總參謀部的命令，各地衛所將領不是上書叫苦，就是走關係找門路，想要拖延幾日再說。還沒有那個衛所將領膽子大到，要煽動手下軍戶反抗朝廷命令的。
這些衛所將領大多是世襲武官，數百年來的承平歲月，也讓這些武官家族同地方士紳、京中勛貴們，結起了深厚的姻親關係。他們在下面搞這種小動作，總參謀部也不好過於蠻幹。
