一、掃蕩倭寇
嘉靖年間，倭寇的侵擾成為明朝東南沿海的一大威脅，肆虐的海盜不僅掠奪財物，還殘害百姓，嚴重影響了社會安定與經濟發展。王崇古，這位嘉靖二十年（1541年）的進士，在擔任兵備副使期間，展現出了卓越的軍事才能和堅定的抗倭決心。
王崇古在常鎮（今江蘇常州一帶）任兵備副使時，面對猖獗的倭寇，他沒有選擇避戰，而是主動出擊。在夏港，他精心部署，利用地形優勢，對倭寇發起了突然襲擊，打得敵人措手不及。此次戰鬥，王崇古的軍隊憑藉着精準的戰術和高昂的士氣，一舉擊潰了倭寇，取得了重大勝利。
倭寇在遭受重創後，企圖逃離戰場，但王崇古並未給敵人喘息之機。他迅速組織追擊部隊，緊隨倭寇之後，一路追至靖江。在靖江，王崇古再次展示了他的軍事才能，指揮軍隊對殘餘倭寇進行了圍剿，確保了這次抗倭行動的徹底性。靖江之戰，不僅消除了倭寇的威脅，也極大鼓舞了當地民眾的士氣。
在陸地上取得勝利後，王崇古並未滿足，他深知要根除倭患，還需控制海洋。於是，他與當時的名將俞大猷聯手，共同策劃海上追擊行動。他們多次出海，尋找倭寇的蹤跡，對其進行精準打擊。在一系列的海上戰鬥中，王崇古和俞大猷的聯合作戰，使得倭寇無法在沿海地區立足，大大削弱了其侵擾的能力。
王崇古在抗倭鬥爭中的英勇表現，得到了朝廷的高度認可。他因此被晉升為陝西按察使、河南右布政使等要職，其影響力也隨之擴大。
二、鎮守陝西
嘉靖四十三年（1564年），正值邊疆動盪之時，王崇古受命出任右僉都御史，巡撫寧夏，肩負起守護邊疆的重任。他不僅深諳兵法，還重視實地考察，對寧夏邊塞的險要地形進行了詳盡調研，為後續的防禦策略奠定了基礎。王崇古親自督修戰守工事，強化邊防，同時積極偵察敵情，採取分化瓦解敵軍的策略，一旦時機成熟，即率軍主動出擊，直搗敵巢。正是這一系列舉措，使得寧夏在周邊地區遭受侵擾時，「獨完」無損，彰顯了王崇古卓越的軍事領導能力。
河套地區的吉能，作為東蒙古韃靼吉囊之子，頻繁侵擾內地，成為陝西、寧夏、甘肅三省的共同威脅。面對這一挑戰，朝廷於同年冬季委任王崇古為兵部右侍郎兼右僉都御史，統轄陝西、延寧、甘肅軍務，旨在改變邊疆不利態勢。上任伊始，王崇古立即調整戰略，下放權力，要求各級將領以軍法嚴格指揮，精心繪製地圖，制定作戰計劃，分派給趙岢、雷龍等將領執行。
通過增強防禦、周密部署，王崇古成功穩定了邊境局勢。在吉能及其部眾再度進犯之際，王崇古指揮有方，不僅有效阻擊了敵軍，還巧妙調動雷龍將軍從興武秘密出兵，突襲着力免（吉能部下）營寨，取得了重大戰果。當吉能再次挑釁時，王崇古迅速反應，一方面親率邊防軍迎擊，另一方面令雷龍從花馬池、長城關發起進攻，最終大獲全勝。
王崇古在陝西邊疆的七年裏，憑藉其出色的軍事才能和堅定的戰略眼光，不僅多次挫敗了吉能等外敵的侵擾，還顯着提升了邊防實力，確保了邊疆的安寧。他的赫赫戰功，贏得了朝廷的認可，從右僉都御史晉升至右都御史，這不僅是對他個人貢獻的肯定，更是對他在維護國家邊疆安全方面所做出的巨大努力的最高褒獎。
三、懷柔政策
嘉靖二十年（1541）以來，吉囊的弟弟俺答汗以及其部眾對明朝邊疆構成了長達三十年的威脅，尤其是東至薊鎮、昌平，西至陝西四鎮的廣大區域，頻繁遭受侵擾。叛賊趙全等人更是在俺答的支持下，佔據古豐州，招募流民，構建起名為「板升」的堅固據點，儼然形成獨立王國，嚴重挑戰了明朝的邊防安全。儘管朝廷懸賞緝拿趙全，但效果甚微，邊關將領腐敗現象嚴重，甚至與敵勾結，導致邊防情報泄露，邊疆形勢日益嚴峻。
隆慶四年（1570），王崇古受命統領宣府、大同、山西的軍務。他深知硬碰硬的軍事對抗難以持久，遂採取了一種更為智慧的策略——懷柔政策。首先，他嚴禁邊軍士兵擅自出關，同時派遣熟悉敵情的人員深
