勢急劇惡化。順治十五年（1658年）四月，蜀王劉文秀病逝。這一時期，大西軍的部分高級將領希望與大順軍餘部聯合起來，共同挽救危局。同年內，清廷部署了三路大軍向雲南進軍，永曆朝廷陷入了風雨飄搖之中。
三、矢志不渝
為了牽制清軍，永曆朝廷派遣使者聯絡夔東十三家兵馬進攻重慶。在閣部文安之和太監潘應龍的組織下，李來亨等「十三家」於十二月初調動七千官兵和一百五十八艘戰船沿長江逆流而上，聯合梁平、萬縣一帶的譚文、譚詣、譚弘所部兵力，直接抵達重慶城下，形成了三面包圍的態勢。後續部隊也分水陸兩路陸續增援。然而，在重慶城下的戰鬥中發生了一場意想不到的內訌——譚詣和譚弘刺殺了譚文，並隨後向清朝投降。這場內部的離析嚴重削弱了抗清力量，使得原本旨在支援永曆朝廷的計劃徹底失敗。
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李定國兵敗撤出昆明後，永曆朝廷曾就下一步行動進行了討論。有人提議繞過清軍主力，進入川東與李來亨為首的農民軍匯合，但這一建議未被採納。順治十八年（1661年），永曆帝被俘，次年被絞死；李定國也在邊境地帶病逝。隨着永曆朝廷的覆滅，清廷派遣使者向夔東地區的農民軍宣佈這一消息，並試圖招降他們。
面對如此嚴峻的局面，李來亨的態度異常堅定。他拒絕接受清廷的招降，繼續堅守抗清的立場。這一舉動不僅體現了他對明王朝的忠誠，也彰顯了他矢志不渝的精神。在清軍的強大壓力下，李來亨和他的部下們面臨着前所未有的挑戰，但他們依然堅持自己的信念，繼續在山區中進行游擊戰，努力保持抗清的力量。
儘管客觀條件極其不利，李來亨依舊堅持組織部隊，採取各種手段維持部隊的戰鬥力。他們依靠山區的複雜地形進行防禦，同時發展農業生產，以保證軍需供給。李來亨還積極尋求與其他抗清勢力的聯合，試圖形成更大的抵抗力量。然而，隨着清軍不斷加強攻勢，夔東地區的抗清力量逐漸陷入困境。
李來亨的矢志不渝精神在當時極為難得，即便在永曆朝廷覆滅、盟友相繼離去的絕望時刻，他也從未放棄抗爭。這種堅定的信念和不屈不撓的鬥爭精神，成為了後人敬仰的典範。
四、重創官軍
康熙元年（1662年）九月，清廷決定對夔東抗清基地實行三省會剿，從四川、湖廣、陝西各抽調三萬名官軍，齊頭並進，向夔東抗清基地發起猛攻。此外，清廷還調遣了駐防西安的八旗兵由傅喀禪等統領南下四川，增強西線兵力；從京師派遣都統穆里瑪、圖海率領八旗禁旅南下湖廣，增強東線兵力。
到了康熙二年正月，四川官軍攻佔了袁宗第部駐守的大昌縣。袁宗第在戰鬥中跳崖逃生，隨後與郝搖旗的部隊合併。與此同時，原據守大寧的岐侯賀珍因病去世，其部眾由其子賀道寧帶領向清四川總督李國英投降。
隨着西線形勢的惡化，湖廣清軍也從東面步步緊逼，佔領了興山縣境內的香溪口。到了七月，郝搖旗、劉體純帶領部下的精兵與李來亨的部隊會合，決定首先對付湖廣官軍。李來亨利用湖廣官軍的驕傲自滿和輕敵心理，事先派出數百名戰士偽裝成清兵和運糧農民，混入官軍營寨。
二十三日，三部農民軍發起全線攻擊，潛伏在敵營的戰士趁機發動突襲，導致湖廣官軍陷入混亂。在激烈的戰鬥中，湖廣官軍的提督董學禮、總兵於大海、穆生輝、高守貴、金萬鎰等將領紛紛落荒而逃，一直退到彝陵。這場戰鬥不僅重創了湖廣官軍，還極大地鼓舞了夔東地區的抗清士氣。
李來亨憑藉其出色的軍事才能和對抗清事業的堅定信念，在極端不利的情況下，成功地組織了一次反擊，給清軍造成了嚴重的損失。這次戰鬥不僅展示了農民軍的戰鬥意志和戰術靈活性，還證明了即使在強大的敵人面前，只要有恰當的策略和堅定的決心，也能取得勝利。
五、勢單力孤
重創湖廣官軍之後，李來亨、劉體純、郝搖旗、袁宗第、黨守素、塔天寶、馬騰雲七部農民軍乘勝西上，從八月二十五日起
