傳說漩渦島過去是一個巨大的島嶼，有兩個國家為了這個島嶼爭吵。洛奇亞作為這座島嶼的守護者感到失望至極，降下電光將島嶼斬為四塊，然後消失在瀑布底端的盡頭，期待着人類和寶可夢之間無形的信任可以再一次出現。
目前四塊島嶼的名字分別被命名為青岩島、赤岩島、黃岩島、銀岩島。除了這四座最大的島嶼之外，還有幾座小到沒有被命名的荒島。
火箭隊的臨時基地就在某座未被命名的小島上。這片海域島嶼周圍遍佈旋渦，如果是在遊戲中，必須使用潮旋才能通過。不過眾人現在騎在飛行系寶可夢身上，並不會因此而困擾。不過這樣高調的行為也有其缺點，島上負責偵查的火箭隊成員憑藉大嘴蝠的超音波發現了眾人，並朝着眾人使用了超音波和空氣利刃。
眾人不得不迫降在島上，然而從降落到島上開始，猛烈的戰鬥就打響了。數量眾多的超音蝠和大嘴蝠朝着眾人撲了過來，其中一名搜查官派出了一隻特性為精神製造者的雄性愛管侍，使用了超大範圍的廣域戰力，把靠近過來的超音蝠和大嘴蝠瞬間秒殺。紫色的大小蝙蝠像是下餃子一樣從天上噗噗地掉下來。
這些超音蝠和大嘴蝠等級都不高，應該是火箭隊的人在附近的島嶼上捕捉的，在面對高等級的寶可夢時，它們就算是數量眾多，也沒有什麼太大的作用。不過對火箭隊的人來說，它們的作用大概也就只是稍微拖延一下時間吧。
「隆隆岩（頑皮雷彈），使用大爆炸！」
火箭隊的人似乎準備撤離了，留下了部分的成員負責斷後，一上來就讓寶可夢無腦地使用了大爆炸。
搜查員這邊對此早有預料，甚至可以說是熟練得令人心疼，廣域防守、守住這類招式用起來速度極快，一看就是經常碰到這種使用大爆炸的寶可夢了。
直樹和葉子跟着一名前輩繞到了戰場側面，向着正專注於主戰場的火箭隊成員發動了奇襲。
「耿鬼，使用暗影球！」
「等等！」
直樹一把堵住了葉子的嘴，給她來了一個腦瓜崩。
「你想殺了他媽？」直樹無語道。耿鬼一個暗影球砸在普通人身上會是什麼結果直樹都不敢想。
葉子乾笑了一聲，捂着頭道：「我忘記了。」
「交給我吧，斗笠菇，使用蘑菇孢子！」搜查官前輩派出了一隻斗笠菇，相當熟練地朝着火箭隊成員灑出了蘑菇孢子。
「可惡，側面有人偷襲！叉字蝠，用順風把蘑菇孢子吹回去！」
「沙奈朵，精神強念！」
「叉字蝠！你......」話還沒說完，蘑菇孢子就像強效安眠藥一樣直接讓這名火箭隊精英陷入了嬰兒般的睡眠。
側面的部分寶可夢被擊敗，正面的阿渡也成功讓快龍使用逆鱗撕開了火箭隊的防線，負責斷後的火箭隊掙扎了一段時間後選擇了投降。留下部分人處理這裏的火箭隊成員，剩下的人則是朝着呆呆獸所在的地方趕去。
「你們來了。」當眾人趕往呆呆獸的所在地時，一名穿着白大褂，戴着無框眼鏡，有些禿頭的研究員一樣的中年男人轉過了身來，看起來好像已經等了很久了。他身後的水池中是一大群尾巴被砍斷了的呆呆獸。
「自我介紹一下，我是火箭隊的首席研究員之一，我叫佐倉三郎。」
「我留在這裏是希望各位能夠協助我進行一項研究。」
「去吧，呆殼獸！」
自稱佐倉三郎的研究員扔出了精靈球，裏面是一隻看上去像是呆殼獸的寶可夢，這隻呆殼獸的頭上和身體上都被加裝了怪異的機械裝置，直樹看向它的時候，面板上顯示着一大堆亂碼。
「來協助測試吧，如果你們贏了它的話，這些呆呆獸就還給你們好了。」佐倉三郎發出了難聽的笑聲。
「快龍，使用雷電拳！」阿渡指揮快龍發動了攻擊，快龍扇動翅膀，快速移動到呆殼獸身前，一拳打在了呆殼獸
