阿蒙內心對海倫壓抑的情感終於徹底爆發了，他一方面鄙夷着猶太人，但一方面又無法控制海倫對自己的吸引，這讓阿蒙把所有責任都宣洩在海倫身上，狠狠地毆打了海倫，用這種方式發泄着自己內心的糾結和矛盾。那種兇殘和偏執、瘋狂和冷酷，一拳一拳地擊打在海倫身上，同時也一拳一拳地擊打在現場每一名觀眾的心間，背後不由就冒出了一片冷汗，他們的靈魂都在瑟瑟發抖。
而與此同時，一場幸福的猶太婚禮在營房裏舉行，辛德勒也在工廠慶祝自己的生日。辛德勒吹滅了蛋糕上的蠟燭之後，親吻了身邊的每一個女人。工廠里的猶太姑娘帶着一個猶太女孩，也捧着蛋糕代表全體工人祝辛德勒生日快樂。辛德勒也親吻了她們，不想這成為一個禍端的開始。
集中營又開始了新一輪的清洗，他們以集體淋浴的名義將猶太人集中起來，但實際上卻是送到毒氣室，將所有人都殺死。這讓猶太人全部都恐慌起來。這一次又有一批猶太人從匈牙利來到了普拉紹夫集中營，為了清理出足夠的營房安排這些猶太人，所以才必須展開新一輪的清洗。
由於阿蒙正在接受身體檢查他因為食用了太多肉食而導致血壓過高，醫生希望他能夠控制一下體重。所以阿蒙就臨時起意，把那些有病的猶太人全部消滅掉。軍官要求所有猶太人都脫光衣服進行檢查，女人們紛紛弄破手指擠出血來塗在臉上、唇上增加血色；而操場上所有猶太人都果體地在接受身體檢查，他們的尊嚴早就已經不存在了，
經過檢查之中，部分猶太人被留了下來，可他們還來不及慶祝，就看到集中營里的孩子們都被趕上了卡車，和那些沒有通過檢查的人一起被帶走了，這頓時讓「倖存者」們都慌了手腳，可即使是拼命吶喊也無法挽回卡車消失在道路盡頭的身影。
可憐的孩子們也都被迫四處逃竄，在集中營里尋找能夠躲避搜索的地方，甚至甘願跳到糞池裏，以求得生命的延續。為了生存，孩子們之間也展開了激烈而殘酷的競爭，只為了能夠活下去，而孩子的童真早就在集中營的殘酷之中被消磨殆盡，這才是戰爭最可怕的地方。
那些被送上卡車的猶太人全部被裝進了火車貨櫃裏，待在悶罐車裏的猶太人承受着烈日的炙烤，口渴難忍。目睹着這一幕的辛德勒給坐在月台上的阿蒙遞上冰鎮汽水後建議叫輛消防車來，用水籠頭朝那些猶太人噴灑，以此取樂。於是，阿蒙吩咐士兵執行，猶太人紛紛用嘴去迎接這生命之泉。看着那些可憐的猶太人，辛德勒不由自主地走了上前，吩咐士兵朝車頂多噴一點，注視着他的阿蒙意識到了什麼，臉上的笑容頓時收斂了起來。
蓋世太保逮捕了辛德勒，罪名是違反了元首的種族法規，在他生日當晚無意中吻了那位送蛋糕的猶太姑娘。阿蒙為了自己的經濟利益，向蓋世太保頭子朱利斯解釋，並為辛德勒說情，用錢解決了問題。辛德勒在受到一番警告後獲得保釋。
1944年四月，在克拉科夫和普拉紹夫猶太人居住區中被殺害的猶太人已超過一萬。阿蒙奉上級之命挖出早已埋葬的屍體焚化，被焚化的屍體冒出的煙灰在空中下了一場傾盆大雨，將整片天空都遮掩住了，散發出來的惡臭更是將空氣完全污染，這一片鋪天蓋地的煙灰就是一個個生命的證明。
辛德勒在那被挖出來的屍體中，再次看到了那抹紅色，那個穿着紅衣的小女孩就這樣毫無生機的躺在推車上，彷佛將整個世界所有的希望都掐滅了一般。
隨後，阿蒙負責把剩下的猶太人運往奧斯威辛集中營。辛德勒得知這一情況後要求阿蒙給他的會計師斯泰恩特別待遇。至於辛德勒自己，他心灰意冷，眼看工廠將難以為繼，他打算回家鄉去，可斯泰恩說可以繼續開廠，當然得另雇新工人。不過辛德勒並沒有答應這個提案，他發自內心地感激斯泰恩，現在他決定帶着自己一輩子都無法揮霍的金錢回到家鄉，回到他的妻子身邊，「這一切總有一天會過去的。」目睹了猶太人的遭遇，辛德勒內心的震撼和傷痕，已經永遠都無法彌補了。
「我本來想說，我們什麼時候喝一杯的。」辛德勒看着斯泰恩，感慨萬分地說到。
「我看還是現在喝比較好。」斯泰恩努力擠出一抹微笑說到，但一行淚水卻在他眼中滑落，因為他知道，這一次離開普拉
