世界初始之樹內。
小智和路卡利歐，同樣遭受到了雷吉艾斯和雷吉斯奇魯的襲擊。
「走這邊！」路卡利歐拽住小智的衣襟，替他承受住了鋼神柱的加農光炮，表情猙獰。
小智慌忙道：「路卡利歐！」
路卡利歐跪在地上，喘息一會兒，繼續帶着小智，朝內部奔去。
一定要讓小智，和皮卡丘重逢……
路卡利歐緊咬牙關。
我不會讓同樣的悲劇，再上演一次！
世界樹內，路徑錯綜複雜。
走散的武藏和小次郎，左右環顧。
「怎麼不見小鬼頭啊？」
「連喵喵也不知道在哪兒……」
兩人齊齊嘆了口氣。
「小次郎，你看這礦石好像很值錢的樣子欸。」
武藏忽然留意到身旁的結晶石，正打算伸手觸碰。
小次郎忽然臉色一變：「危險！」
「什麼？」武藏扭頭，只見一隻宛如紅色岩漿般的搖籃百合，伸出捕手，將武藏束縛在內。
「這是什麼東西啊！」武藏大叫道。
「看上去…就好像是殺滅體內細菌的白細胞一樣。」
小次郎臉色慘白，呵聲道：「雙彈瓦斯，沙漠奈亞，快去救武藏。」
可當兩隻精靈上前之時，武藏早已被白細胞吞沒，消失在了原地。
而在小次郎身後，相似的化石寶可夢幻影，試圖將小次郎吞噬。
「唔！」小次郎奮力掙扎着，用盡全力拋出精靈球，「風鈴鈴，你們都快點逃吧！」
遇難的最後一刻，小次郎最後的選擇，是將精靈們盡數釋放。
「鈴~~」風鈴鈴和雙彈瓦斯相望，淚流滿面。
與此同時。
陸野和大吾已然走入世界之樹的內部。
樹幹內部，別有洞天，溪流潺湲的流淌而過。
四處是珍稀樹果、名貴礦石，化石寶可夢隨處可見。
「簡直是世外桃源…」大吾喃喃道。
「三神柱正是因為，不想讓人類打擾這份寧靜，所以才擔任守衛的吧。」
陸野低頭望着手機，思忖片刻，還是關掉了相機。
「下次還有機會過來的。」陸野自顧自點頭。
「這裏的道路太複雜了。」大吾皺眉，「陸老師，你能聯繫上小智嗎？」
「手機也沒信號。」陸野搖晃了下手機，笑道，「但是我有傑尼龜。」
「啊？」
「傑尼！」傑尼龜閉上雙眼，感受着路卡利歐的波導，指向洞穴深處。
大吾順着望去，謹慎地邁步向前，回頭道：
「走吧，陸老師，沒有發現那兩隻神柱的蹤影。」
四下寂靜無聲，大吾微微一怔。
環顧四周，都不見陸野的蹤影。
大吾的笑容凝固住了，目光一凜，抬手派出巨金怪：
「小心點，巨金怪…有會瞬間移動的傢伙，在這附近！」
……
陸野剛剛還和大吾談笑風生。
等到回過神來之時，已然置身於世界之樹的頂部。
寒風拂面，陸野的眼前是一片濃濃的雲海。
低頭往腳下鳥瞰，是世界樹的萬丈高空，不由膽寒。
「皮卡！」
「幹部~~！！」
身後忽然傳來皮卡丘的叫聲和喵喵的哭喊。
陸野轉過身，只覺得眼前飛過一道粉紅色的身影。
「繆~~」
陸野往左看看，又往右看看，突然抬頭，見夢幻正竊竊偷笑着。
是夢幻的瞬間移動，帶我來這兒的嘛…
陸野想到這點，忽然被喵喵撲了個滿懷。
喵喵抱着陸野，涕淚俱下道：「夢幻一直要喵喵陪它玩…已經一天一夜了喵！」
「喵喵想見小次郎，還有武藏啊喵！」
「皮卡皮……」皮卡丘也站在一旁，耷拉着耳
