以下是精簡版的大綱設定和劇情主線；
上古時代
太一生水，水反輔太一，是以成天。天反輔太一，是以成地。天地復相輔也，是以成神明。
上古，太一自混沌中生。創水，進而創萬物。最後融身為元散與於世間，滋養天地生萬靈。
（這個時期生物體積巨大，留下骸骨奇觀）
後人族生，所謂昊天上帝者，蓋元氣之廣大，則稱昊天，遠視蒼蒼即稱蒼天，人之所尊，莫過於帝，託之於天，故稱天帝。
昊天以一己之力，鎮壓諸靈滅萬靈神獸，令下屬做山海經以記其功。
惹怒太一元靈，散盡最後神思，以天網制之強行禁錮其與九天之上，阻絕太一繼續變強。
此時人間人族征戰不斷，昊天以畢生修為突破一層天網，以神識化為炎黃，滅蚩尤建立一統。
為突破太一之網，再次化為道教之祖，天元真人。流傳修煉功法，引導修士飛升，企圖以元破元。（凡人飛升之日，元氣與一至九層天盡散）
為人間制定秩序，並以神力制九鼎助人王，人間天下獨尊昊天。
後人王嬉樂失九鼎，群侯四起逐鹿中原。始皇帝掃平六合，登基天下，從九鼎上得知秘密。焚書坑儒不尊昊天，自稱始皇帝，創立新教替代昊天摧毀其神格，以求長生的名義對天下傳教。
（因皇帝之稱）冒犯上天昊天降下天罰，秦滅，天下大亂。新教傳播者一東一西一南。西進天竺，結合道教創立佛教（不飛升，坐化散盡修為修來世）
東進東海，創立日本形成巫道。南至迷澤，創立巫教，後部分迷澤大能回到中原，創立醫道。（不修己身，只利用元氣淬物）
秦滅漢取。（目睹秦皇手書得知真相後，漢皇立遺詔，告誡子孫需獨尊昊天，不可修邪魔外道。命令司馬史家修改前朝史，污衊暴秦。司馬家卻暗中將真實歷史和始皇手書拓本保存了下來，紋身於司馬遷之妻的背上，以精怪之血做成的顏料，保證千年後真相可以大白。）
有秦始皇前車之鑑，為制衡天下鞏固神格，昊天不時化人身製造混亂令天下人相殺鞏固其神格（人力所不能為者，求於神也）。
另一方面，藉助飛升修士之元破九重天網。
自此之後歷朝歷代，人間帝王思慮如何保持王朝穩固。
（三國時期，曹操摸金校尉掘漢皇陵得傳國玉璽上的漢皇遺詔，奉為真命傳家。）
修士則思考如何能飛升九天，不令元氣於九天之前盡散，突破九重天成功飛升。
（修為達到九重，便有冥冥指引，引其飛升。）
直至唐朝。
隋末天下大亂，世家出身的隴西李氏有子世民，見天下民不聊生。看過隋王玉璽上的漢皇手書，不禁對漢皇手書產生了質疑。（太宗時十六，未及加冠。蒙陰承執金吾衛。一日偶見殤王印，窺見傳國手書。殤王戲之，傳玉璽與太祖，問何如？太祖答曰：當今陛下大奉昊天上帝，率百官萬民歲祀上帝於承天台，可稱虔誠。然何以餓殍遍地，天災連連，農無收成以果腹，妖魔精怪橫行於夜，民不得安生？殤王不悅，斥貶太祖，後遷怒於高祖。）
被剝奪金吾衛的職稱後，太宗開始修道。天賦異稟，一月明理，三月靈光，半載歸元，後開天竅，至典御。
偶遇古墓，掘之。得秘寶，克玄引。三年超物。時殤王舉國力三征高句麗，未果。又大興土木修昊天宮，居宮中以圖昊天上帝佑大隨。殺諫官，貶錚臣，不知天下群雄四起也。
太宗隨太祖於太原起兵，收天下英雄，除妖魔衛道，終成大業。
業成，太宗奉秦王，領天勝元帥職。深居府中十載，一朝悟道。
太祖崩，傳國於太宗。
創儒道，推封正法，率文物百官，合世家宗族，聽民生疾苦，大治天下，開貞觀太平。）
大結局
