從此以後，細川輝元便被安排到會同館居住，因為吉田宗桂還曾被嘉靖皇帝的封為御醫，所以有了這層關係，時不時的還可以入宮覲見一下嘉靖皇帝，彼此談談心，聊聊天。一些超越現代的新想法、新思路，讓嘉靖皇帝茅塞頓開，比以往更加的英明苛查。給予細川輝元的賞賜也越來越厚重，並借着皇帝的恩寵，細川輝元經常可以走訪各處的達官貴人。
其中，着重交好的有裕王朱載垕，內閣次輔徐階，翰林院學士張居正等等。着重給他們講述日本皇權如何淪落（指幕府權利），百姓如何疾苦，並隱晦的提出明王朝的各種矛盾和危機，特別是嚴嵩專政、朝綱頹廢、官吏腐敗、「南倭北虜」之患、土地兼併造成民不聊生之苦。對於這些詬病，細川輝元結合後世的經驗提出改善的可行性辦法，供他們參考和討論。
現在的朱載垕剛剛二十歲，正值青年，思想進步，樂於開拓進取，而且最重要的是，他就是未來的隆慶皇帝。
可惜少年的時候因其母親杜康妃失寵，自己又非長子，所以很少得到父愛。所謂福兮禍之所依禍兮福之所伏，幼年的經歷使朱載垕較多地接觸到社會生活各方面，了解到明王朝的各種矛盾和危機，使他在登基前關心朝局，並對他登基後處理政務有着較大的影響。後來倚靠高拱、陳以勤、張居正等大臣的盡力輔佐，實行革弊施新的政策，海內外得到大治，史稱隆慶新政。唯獨因為他沉迷媚藥，也服這些媚藥助興，導致荒於政事。因此朱載垕在位6年，因病去世，終年36歲。廟號穆宗，諡號契天隆道淵懿寬仁顯文光武純德弘孝莊皇帝。葬於十三陵昭陵，後傳於位朱翊鈞。明穆宗寬仁大度，勤儉愛民，留心邊陲之事，處理都恰到好處，可以稱之為明主。
但是今世由於細川輝元的介入，已經從根本上杜絕了他的這種不良習慣。
三個月後，終於確定了汪直的歸屬，封汪直初授武德將軍，驍騎尉，官拜水軍正五品千戶宣慰僉事。自從當初汪直歸降後，朝野內是一片譁然，招降與剿滅的意見一直不統一。直到細川輝元提出了《明盜法典》與《私掠許可證》制度，讓明朝的小夥伴們都驚呆了，原來海盜還可以這麼玩啊。戰時作為義務兵，歸屬於國家軍隊用於作戰，和平時期頒發《私掠許可證》，作為合法海盜搶掠目標國家，所得財貨65歸國有，剩下35歸船隊所得。若所得財貨拒不上繳，則吊銷營業執照，其它合法經營者可進行剿討，所得按比例分成。
強制規定海上作業海盜必須遵守《明盜法典》，拒不執行者，群討之。法典規定如下：
一、對日常的一切事務每個人都有平等的表決權（為了防止賊首坐大）。
二、偷取同夥的財物的人要被遺棄在荒島上。
三、嚴禁在船上賭博。
四、晚上8點準時熄燈。
五、不許佩帶不乾淨的武器，每個人都要時常擦洗自己的槍和刀。
六、不許攜帶兒童上船，勾引婦女者死。
七、臨陣逃脫者死。
八、嚴禁私鬥，但可以在有公證人的情況下決鬥，殺害同伴的人要和死者綁在一起扔到海里去。嚴禁侵犯大明王朝的人民及領土利益，侵犯者死。
九、船隊所得按勞分配：船長和軍需長分兩份，炮手、廚師、醫生、水手長分1.5份，其他有職人員分1.25份，普通水手分1份，剩餘份數存入「公共基金」。因公致殘，根據傷殘情況從「公共基金」內進行對等補償。
十、官贖：若想回到故土安身立命，可憑官方證明辦理入戶手續，可根據繳納稅款獲取對等勳爵。（俗稱洗白白）
這項重大變革使得大明海域的眾海盜措手不及，頓時體會到了「同行是冤家」這句至理名言，洗白的海盜第一件事就是剿滅海盜，如此合理化的繳獲財貨，想想都覺得好爽。那些想負隅頑抗的賊首們則整天提心弔膽，生怕哪天被手下的人譁變把他宰了，為啥？看看人家的《明盜法典》，每個人都有表決權啊，還分錢分裝備啊，最後還可以贖身買爵，享樂後半生好吧。更有海盜王汪直作為活字招牌，大明王朝很快就將明朝周邊海盜剿滅的剿滅，招撫的招撫。
趁着成效如此卓著，細川輝元又提出《開海通商條例》，設立海關收取關稅的做法，並且恢復日本的朝貢貿
