墨菲享受了不到兩天的時間，救世主尼奧又一次站在了自己的面前，這個速度不能說快也不能說慢，畢竟雙方之間是戰爭，每時每刻都有人類死亡，而『矩陣』一方死亡的不過是機械體罷了。
墨菲不知道發生了什麼，為什麼尼奧又來了，這個對於他來說並不滿意，也不知道他的能力有沒有體現在現實中？
「你來的到是很快，不過我想知道你在現實中是否有什麼不同呢？」墨菲歪着腦袋上下打量着尼奧，隨後問道。看不出來，畢竟這裏是虛擬世界，尼奧依然是原來的樣子，墨菲只能問問了。
「你怎麼知道我在現實中會有變化？你對一切都很了解嗎？」這次尼奧也是疑惑的很，對方好像知道的很多，一切都好像是他在掌控之中一樣。
「知道的不少，需要的更多，解釋就不用了，讓我看看你又有什麼變化，敢於再次出現在我面前？」墨菲可沒有給對方解釋的義務，他現在想要知道尼奧在現實中是否有了變化，自己怎麼才能得到這種能力？
尼奧擺出了架勢，但是墨菲並不看好在虛擬世界中他和自己戰鬥，對方必然有什麼想法，不然不會這麼明目張胆的站在自己面前。
墨菲思考了一下，『是第三部中幹掉史密斯的方式嗎？』
第三部中史密斯在虛擬世界也算是無敵的存在了，尼奧被打的半死，隨後被史密斯同化，而此時是『矩陣』幫助尼奧進行連接，隨後『矩陣』加大能量的輸入，通過尼奧的身體進行傳遞。不過傳遞的能量還是病毒不得而知，史密斯從內部開始崩潰，隨後全部消滅，虛擬世界恢復了正常。
墨菲笑了笑，如果是這樣的方式，沒準自己不用去找『矩陣』的端口，直接通過尼奧就可以將他們兩個同時抓住，試試吧！
尼奧沖了過來，不過和上次沒有什麼區別，墨菲輕鬆的抓住了尼奧的拳頭，「你沒有什麼進步啊，是誰給你的信心再次挑戰我呢？」自大的表現是一定要的，畢竟對方也不傻，演戲就要演的專業。
墨菲輕鬆的完虐着尼奧，抓着他的拳頭不斷的摔打着，掄起來砸向地面，遠方的墨菲斯和崔妮蒂看的一陣揪心。
……
墨菲斯的飛船沖向『矩陣』的主機位置，這需要莫大的勇氣，迎面而來的是鋪天蓋地的機械章魚，另外還有大型的戰艦，他們就像是海洋中的一葉小舟。
大家抱着必死的決心進行衝擊，尼奧不負眾望的在現實中掌握了能力，死亡的威脅讓他有了突破，不過他們的力量太小了，根本無法對抗『矩陣』，飛船墜毀，尼奧面對『矩陣』提出了計劃。
『矩陣』最後同意了，墨菲的威脅對它來說太大了，畢竟他不可能放棄虛擬世界，飼養的人類需要一個精神世界，這樣他們才會在裏面沉睡而無法自拔。而『矩陣』在虛擬世界中無法定位墨菲的位置，即便墨菲就站在那裏進行破快，它都找不到墨菲。
於是尼奧再次來到墨菲的面前，他是要犧牲自己，讓『矩陣』可以採取現實中的手段對付墨菲，當然他們不知道墨菲到底是什麼，為什麼這麼強大，但總是無法逃脫一個規律，墨菲是一個程序，他們如此判斷。
……
現在尼奧感覺自己快死去了，躺在破碎的地面上，抬頭看着天空，墨菲低着頭注視着他，「看來你的用處不大了，那麼實現一下最後的價值吧！」墨菲開始吸收尼奧了。
尼奧的身軀開始分解，星星點點的被墨菲吸收，崔妮蒂看着一切不停的落淚，先知對她說她會愛上救世主，而她確實愛上了，可惜只有幾天的時間。
墨菲吸收了尼奧，還好是虛擬世界之中，尼奧也不過是一些數據罷了，不然真的太噁心了。但是得到的東西確實有些驚喜，尼奧真的在現實中完成了進化，沒錯就是進化。
信息量很大，不過主要是記憶信息，以及一些尼奧本人無法掌握的大腦異變。人類的大腦真的非常的神奇，裏面有無窮無盡的寶藏，可惜人類自身無法開發，只能依靠變異或者刺激，這種情況一般是無法掌握的，只能依靠……意外。
然後尼奧進入虛擬世界的方式讓這種意外數據化，成為了墨菲可以掌握的情況，不過危險是依然存在的，另外一點讓墨菲無比的鬱悶，人類的意識進入虛擬世界需要一個接口，就在腦袋
