高務實不知道把漢那吉和脫脫二人在討論他請活佛來土默特的事，更不知道他們覺得這件事很大、很難，因為對於高務實而言，這是一件很簡單的事。
為什麼很簡單？因為這個時期的黃教有兩個基本點：一，急需發展；二，敬畏大明。
急需發展的問題前文有提到，黃教也就是格魯派在其當地被打壓得很嚴重，有蒙古這樣大的發展空間，對他們來說實際上是很關鍵的，否則當初索南嘉措活佛也不會和俺答汗一拍即合，互賜尊號什麼的，搞得不亦樂乎。
而同時，格魯派是很畏懼大明的，有多畏懼呢？阿興喇嘛在蒙古傳教的時候就以「少造殺孽」為由，勸蒙古人不要和大明敵對；到了索南嘉措和俺答會晤的時候，又再次強調了這一觀點，還大力讚揚俺答接受封貢的舉動。
為什麼會這樣？
這事說來話長，這裏長話短說：大明很早就對藏區建立了都指揮使司、衛、所的行政體制，早年間就陸續委任了不少藏族首領擔任都指揮使司和衛所的官職。
大明的歷朝實錄和一些藏文史料中都不乏這類關於藏族首領朝貢、受封賞的記載。由此我們可以說，至少在明朝的前半期，明朝的都指揮使司、衛所的行政體制是在包括烏思藏在內的廣大藏族地區得到切實施行的。
而到眼下的萬曆朝，由於隆萬大改革——或者更廣泛一點說是嘉隆萬大改革的推進，實際上在周邊國家和地區政權看來，大明都是極其強大的存在。
再加上大明朝廷的政策一貫是外人眼中的暴脾氣政策，所以除了左翼蒙古察哈爾部由於腦袋上頂着大元二字而沒法跟大明和解之外，其他周邊國家個部族幾乎沒有哪家想跟大明對着幹，全都老老實實的，只盼着別得罪大明這個暴躁老哥，以免被按在地上死捶。
而具體到格魯派呢，還有一點歷史原因要說。
格魯派的創始人宗喀巴（1357—1419）是青海湟中縣人，7歲出家，16歲時到拉薩學佛。他拜數十位各派高僧為師，學通佛法，後來自己招收弟子，宣傳自己的佛教主張。
他得到了帕竹政權的闡化王扎巴堅贊和內鄔宗宗本南喀桑布的支持，於永樂七年（1409年）正月在拉薩發起正月祈願大法會，並在同年興建甘丹寺，由此建立起格魯派。
格魯派宣佈在教理上繼承了阿底峽和仲敦巴所傳的噶當派的教法，因此許多噶當派的寺院轉為格魯派，所以發展很快。宗喀巴在世時，其弟子扎西貝丹建哲蚌寺，釋迦也失建色拉寺，與甘丹寺合稱為拉薩三大寺，這是格魯派早期的基礎。
宗喀巴去世時，格魯派還沒有採用活佛轉世的辦法來解決領袖人物的繼承問題，是由他弟子賈曹傑、克珠傑等相繼繼承他的法座，稱為甘丹赤巴。
此後不久，新興的格魯派就受到仁蚌巴家族的限制和打擊，處於低潮。這期間有宗喀巴晚年時的一個弟子根敦珠巴在日喀則新建扎什倫布寺，成為格魯派在後藏地區的中心。
根敦珠巴去世時扎什倫布寺的法台仍是由其弟子繼承，但是同時有一些人認為在達那地方出生的根敦嘉措是根敦珠巴的轉世，並把根敦嘉措迎請到扎什倫布寺居住。
由於當時格魯派中還沒有實行活佛轉世的制度，所以根敦嘉措的地位一直難以確定。後來根敦嘉措受到扎什倫布寺法台意希孜莫的排斥，離開扎什倫布寺到哲蚌寺學佛。
根敦嘉措在前藏各地活動，逐漸有了名望，他又在山南興建了曲科傑寺。正德七年，意希孜莫請他返回扎什倫布寺，讓他擔任扎什倫布寺的法台，這可以說是格魯派中活佛轉世對師徒相傳取得了優勢。
這時，仁蚌巴下令禁止格魯派僧人參加拉薩正月的祈願大法會，哲蚌寺僧眾請求根敦嘉措返回。正德十二年，根敦嘉措出任哲蚌寺法台，正德十三年，由他主持拉薩正月祈願大法會，爭回了格魯派僧人參加祈願大法會的權力。到了嘉靖四年，他又兼任色拉寺法台。
從此，根敦嘉措的歷輩轉世都要擔任哲蚌寺和色拉寺的法台，這就使他的轉世系統的影響和實際地位超過了甘丹赤巴，成為格魯派的實際的領袖。內鄔宗宗本還把哲蚌寺的別墅送給他，改名為甘丹頗章。
此後便是索南
