十幾天後，不知道遭到多少次攔截的佔領軍被迫分兵，亞特蘭蒂斯戰艦突然兵分幾路，各自逃向不同的方向，追擊艦隊也不得不分兵追擊。
分兵最直接的後果就是各路艦隊的戰艦數量減少，追擊艦隊在判斷亞特蘭蒂斯戰艦位置的時候變得更加的容易，一時間佔領軍的損失直線上升。
如果亞特蘭蒂斯人知道人類是如何探測到他們的動向，絕不會做出如此愚蠢的舉動。
失去了艦隊指揮官的佔領軍什麼也顧不上了，只想着怎麼才能逃脫追殺，各路艦隊各顯神通，有的甚至調頭飛回太陽系的方向，也有的冒險脫離超光速，轟轟烈烈的追擊戰漸漸向捉迷藏轉變。
一路佔領軍脫離超光速的時候幸運地碰上了一個星系，鑽進星系內的十幾艘亞特蘭蒂斯戰艦成功地躲過了人類的追殺。
不過其它佔領軍就沒有這樣幸運了，兩個月後，最後一艘仍然在遠征軍監控之下的亞特蘭蒂斯戰艦在距離太陽系一百零六光年的地方被追擊艦隊鎖定，隨着動力衝擊艦的啟動，這艘戰艦灰飛煙滅，為追擊戰畫下了一個大大的句號。
這場你追我趕，鬥智鬥勇的追擊前前後後持續了兩個月零四天，追擊艦隊付出了六百多艘動力衝擊艦和二十多艘戰神級戰艦的代價，終於殲滅了逃亡的敵軍。
追擊戰的結束也標誌着反攻戰役徹底結束，據戰後統計。亞特蘭蒂斯佔領軍的兩千多艘戰艦，最終成功逃離的還不到五十艘，其中一多半兒是在剛剛開始逃離的時候脫離超光速，直接在太陽系外圍隱藏起來，才意外躲過了追擊艦隊的追殺。
這些戰艦，包括隱藏在另一個星系中的十幾艘戰艦為了躲避遠征軍，始終沒敢離開藏身之地，直到人類撤離太陽系。
安排完追擊任務的徐世傑帶着其餘的戰艦抵達地球，美俄歐三方的艦隊隨後趕到，蒙哥牛利等人正準備帶領艦隊降落。事先抵達的艦隊正好趕在這個時候送回了最新的情報。通訊參謀飛快地跑到徐世傑面前敬禮：「報告，全球各地發現大批亞特蘭蒂斯軍隊失控，佔領軍正在屠殺人類，破壞城市。」
旗艦的大屏幕隨着通訊參謀的報告及時切換鏡頭。只見屏幕上十幾個穿着金色鎧甲的亞特蘭蒂斯戰士衝上繁華的大街。兩輛懸浮車當即被亞特蘭蒂斯人掀翻。滿街的人類狼奔豕突四散奔逃，雖然聽不到任何聲音，但是在場的所有人都可以想像配合這副景象的尖叫和混亂。
全球各個主要城市的標誌性建築一一出現。折斷的埃菲爾鐵塔個、燃燒的凱旋門、倒塌的帝國大廈……最後屏幕的鏡頭停在金字塔邊的獅身人面像上，幾個亞特蘭蒂斯人正聚集在破損的人面像下面，幾十個人騎着駱駝瘋狂地逃跑，一道分解光束掃過，十幾頭駱駝連帶着騎在駱駝身上的人一齊消失不見。
徐世傑的表情無比陰沉：「有多少亞特蘭蒂斯人滯留地球？」本以為亞特蘭蒂斯陸戰軍團會隨着戰艦一齊升空，沒想到佔領軍升空時居然將陸戰軍團留在了地球上！
換作前進艦隊襲擊ym174之前，地球佔領軍的陸戰軍團確實一直呆在戰艦上，不過自從ym174遭到襲擊之後，佔領軍一改之前的緩和政策，開始強勢打壓人類的反抗力量，陸戰軍團也是從那個時候開始常駐地球。
遠征軍的襲擊來得十分突然，佔領軍根本就來不及將陸戰軍團收回戰艦，而且佔領軍從來不覺得人類有擊敗佔領軍的能力，所以也沒有收回陸戰軍團的必要。
可在是佔領軍的艦隊失利之後不得不被迫逃離太陽系，地球上的陸戰軍團頓時成了沒娘的孩子，他們即不想被人類俘虜，又無法逃離地球，唯有困獸猶鬥。
通訊參謀抿着嘴搖了搖頭：「現在還不清楚，以目前的情況來看，保守估計敵軍總數不會低於十萬。」
「十萬？」徐世傑心頭一沉。
遠征軍的真實實力其實比亞特蘭蒂斯佔領軍差得多，只是佔了出其不意和武器方面的一點優勢，才能成功地趕走佔領軍。
遠征軍一百二十艘戰艦外加前進艦隊二十一艘戰艦攜帶的機甲突擊兵團總數不過一萬兩千出頭，與敵人的兵力對比只有十比一，而且機甲部隊的新裝備還沒經歷過實戰的檢驗……機甲部隊到底能不能擊敗亞特蘭蒂斯陸戰軍團還是個未知數。
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