雖然和黃立極、徐光啟談論陝西事務時，朱由檢擺出了一副胸有成竹的神情。一筆閣 www。yibige.com 更多好看小說也讓這兩位內閣大臣們接受了，他提出的看似和稀泥的主張。但朱由檢心裏並沒有表面上看起來這麼樂觀，會談後他讓人先送走了黃立極，自己則留下和科學院的院士、研究員們交談了一會，這才轉身離開了科學院。
乘坐馬車返回皇城的朱由檢，並沒有直接回去後宮，而是去了總參部所在的武英殿。得到皇帝駕臨的消息之後，孫承宗便帶着總參謀部的成員們走出了殿門前來迎接崇禎。
朱由檢走上月台後，對着向自己屈身行禮的官員們揮了揮手說道：「不必多禮了，都進去說話吧。朕今日過來，就是想知道昨日朕命人送來的文件，總參謀部討論出結果來了嗎？」
孫承宗直起了身子，看着崇禎說道：「臣等到是討論過了，但是現在尚沒有得出結果，陛下不如先入殿再說？」
看着孫承宗側身作出邀請的姿勢，朱由檢轉着眼珠想了想，便沉默的向着武英殿內的會議室走去了。在會議室內坐下不久，朱由檢便再次向孫承宗等人說道：「這樣，就從孫先生的下手開始，每個人都發表一下自己的意見好了…」
孫承宗看了會議桌周邊的下屬一眼，便點頭贊同道：「這樣也好，就從伯雅開始吧。」孫承宗說着便轉頭看向了自己右手邊的孫傳庭，以眼神示意他起身發表意見。自從孫傳庭進入總參謀部後，因為他的進士身份，加上個人的才能，很快便取代了外放的袁崇煥，躍居於茅元儀之上了。
而出身於山西代州的他，在爆發了晉商通敵案之後，山西本地官吏的紛紛落馬，也使得他成了不少山西士紳支持的對象，這讓原本默默無聞的孫傳庭，在京中倒是漸漸聲名大噪了起來。
面白而短須的孫傳庭，看起來就如一尋常的文士，得到了孫承宗的指示後，他便起身不疾不徐的向崇禎說道：「洪巡撫帶領賀人龍、艾萬年兩軍不足萬人，獨力剿滅了陝西高迎祥、紫金梁等多股土賊合併的數萬大軍，為陝西地方解去了大亂的危機，從這個結果來看，他們的確是有功之臣。
雖然，在平亂過程中，洪巡撫處置有不當之處，軍中的將士也有違背軍紀的行為，給朝廷造成了很大的困擾。但是現在如果我們要對洪巡撫和軍中將士進行處罰的話，不僅會坐實了官軍濫殺無辜的傳聞，也許還會引起立功將士的不滿，剛剛安定下去的陝西局勢，也許又會出現反覆。
臣以為，是不是對賀人龍、艾萬年兩將加以懲罰申斥，放過下面的將士，將這件事進行冷處理為好…」
接下去的幾位參謀，也都認同了孫傳庭的主張，唯有盧象升站起來之後，卻慨然反對道：「如果放着殺戮平民的將士不管，這是置朝廷綱紀於何物？我們今日因為擔憂賀人龍、艾萬年兩軍會仗着武力反對朝廷律令，因而不做處罰。
那麼他日再有軍中將士犯錯，我們究竟是管還是不管？若是不管的話，武人挾兵自重，豈不是要蔚然成風？武唐藩鎮之禍，將始於今日…」
朱由檢聽了半天，終於明白了，總參謀部為什麼不能做出一個統一的決定出來了。在從前，雖然他抽調了不少軍校畢業生加入總參謀部，但是這些畢業生在孫承宗、茅元儀等老師的面前，就算有意見也不會太過堅持。
但是孫傳庭和盧象升卻不同，基於文官出身的習慣，他們很自然的把自己放在了和孫承宗平等的地位上，對於參謀部的其他人員也沒有過多的想法，因此可以很自然的堅持自己的主張。
被崇禎授予了元帥職銜的孫承宗，雖然一如既往的獲得了崇禎的信任，但是作為一名士大夫，他還是很明白權力的界限在什麼地方的。他現在的地位實在太高，若是還要再獨攬總參謀部的大權，朝野上下不安的文官們，恐怕就要把他當成最大的靶子來打了。
因此，在被授予元帥之後，孫承宗對於總參謀部的具體事務就很少再進行干涉，倒是差不多成了皇帝的傳話筒。
在這樣的局勢下，剛剛加入總參謀部不久的孫傳庭和盧象升，很快就同茅元儀分庭抗禮了起來。茅元儀在武官面前倒是毫無畏懼的心理，但是進士出身的文官面前，他總是下意識的想要退讓三分。在袁崇煥面前他是這樣，在孫傳庭和
